Для размещения ульев в зимовнике делают стеллажи в два-три яруса: первый ярус на высоте 20—25 см от пола, второй и третий — на одинаковом расстоянии один от другого. Над ульями оставляют пространство 20—25 см для устройства вентиляции через верх ульев и постановки в них деревянных мышеловок. Стеллажи изолируют от стен и потолка зимовника, норы в стенах забивают песком с битым стеклом. Летом двери зимовника и вентиляционные трубы держат открытыми. После просушки зимовника стены, потолок и стеллажи белят известью. Ремонт и подготовку зимовника заканчивают не позднее 10 октября. В середине и конце октября в Западной Сибири иногда бывает потепление и пчелы могут облететься, но с наступлением похолодания в конце октября или начале ноября ульи можно убирать в зимовник, не дожидаясь выпадения дождя или снега. Перед постановкой в зимовник с ульев убирают газеты, толь и другие утеплители, плохо пропускающие воздух, оставляют только травяные маты или пористые подушки. Летки закрывают задвижками. Крышки снимают и складывают под навес. Ульи переносят на носилках с крючками, захватывающими их с двух сторон. При переноске следят за тем, чтобы улей на наклонялся в ту или другую сторону, так как при наклонах рамки смещаются и давят пчел. Если на пасеке остались ульи со слабыми семьями, то их ставят на верхние стеллажи, а ульи с более сильными семьями — на нижние, летками к проходу.
Через 3—4 ч после уборки ульев в зимовник пчелы успокаиваются, и летки открывают на ширину 3—5 см. Дверь и все вентиляционные трубы оставляют открытыми до тех пор, пока температура н-е понизится до — 3—5 °С. После этого закрывают дверь и люки, а при дальнейшем снижении температуры уменьшают просветы вентиляционных труб,  затем  определяют температуру,
при которой пчелы сидят спокойно к ие вылетают из ульев. Нормально зимующая семья издает едва слышный шум через леток улья. Шум всех семей образует тихий ровный гул в помещении зимовника. В первые 5—10 дней после постановки ульев в зимовник устанавливают оптимальную температуру. Для устройства верхней вентиляции сдвигают на ульях подушки или маты и загибают положки от задней стенки каждого улья, а в ульи за вставную доску ставят мышеловки. Через 3—5 дней мышеловки, в которые попались мыши, заряжают вновь. В дальнейшем зимовник посещают не чаще двух раз в месяц, главным образом при резких изменениях наружной температуры. Входят в зимовник без шума и стука, имея при себе электрический фонарик. При посещениях зимовника обращают внимание на общий гул, вылеты пчел из ульев, шум отдельных семей. Если семьи хорошо подготовлены к зимовке, то пчелы в течение всей зимы не нуждаются в уходе. Иногда волнуются не все, а лишь отдельные семьи. Зачастую их удается успокоить, сняв с положков верхние подушки.